Dennoch wäre es nicht richtig, davon auszugehen, dass alle Viren, Bakterien und Pilze aggressive Mikroorganismen sind, die den menschlichen Körper befallen können. Der menschliche Körper wird  im Normalfall von einer großen Anzahl Keime besiedelt, die die sogenannte kommensale Flora  bilden.

Körperhygiene muss demzufolge eine ausgeogene Hygiene sein, d.h., sie muss die Ansteckungsrisiken durch pathogene Organismwen, die von Mensch zu Mensch übertragen werden können, begrenzen und gleichzeitig die uns umgebenden und von uns aufgenommenen mikrobiologischen Floren respektieren