L'hygiène corporelle est une pratique essentielle qui contribue grandement à réduire les infections par des micro-organismes pathogènes, notamment en limitant les contaminations inter-individus.
Cependant il serait inexact de considérer que tous les virus, bactéries et champignons sont des micro-organismes agressifs et invasifs pour le corps humain. En fait, le corps humain est normalement colonisé par un grand nombre de germes qui constituent la "flore commensale".

L'hygiène corporelle doit donc être une hygiène équilibrée ; c'est à dire qu'elle doit permettre de limiter les contaminations inter-individus des organismes pathogènes tout en respectant les flores microbiologiques qui nous entourent, ainsi que celles que nous hébergeons.